В соответствии с Конституцией Республики Башкортостан, судебную власть в республике осуществляет Конституционный Суд Республики Башкортостан, федеральные суды и мировые судьи. К судам непосредственно Республики Башкортостан относятся Конституционный Суд РБ и мировые судьи.
Полномочия, порядок образования и деятельности судов Башкортостана определяются Конституциями РФ и РБ, федеральными законами и законами Республики Башкортостан.
Деятельность Конституционного Суда РБ направлена на защиту в республике конституционного строя, основных прав и свобод человека и гражданина.
КС РБ разрешает дела о соответствии Конституции РБ законов РБ, нормативных правовых актов Госсобрания, Президента и Правительства Республики Башкортостан, местных органов государственной власти республики, а также органов местного самоуправления.
Акты или их отдельные положения, признанные Конституционным Судом РБ неконституционными, утрачивают силу. КС РБ дает толкование Конституции РБ, рассматривает иные конституционно-правовые вопросы, отнесенные к его компетенции федеральным законом и законом Республики Башкортостан. Решения Конституционного Суда РБ, принятые в пределах его полномочий, не могут быть пересмотрены иным судом.
Судьями судов Башкортостана могут быть граждане РФ, достигшие 25 лет, имеющие высшее юридическое образование и стаж работы по юридической профессии не менее пяти лет. Финансирование судов РБ должно обеспечивать возможность полного и независимого осуществления правосудия.
В Республике Башкортостан создано 215 судебных участков, на каждый из которых приходится одна должность мирового судьи. Башкортостан стал первым субъектом Российской Федерации внедривший на своей территории институт мировых судей.